来自冥王星的巨大陨石Tanatos（希腊神话）威胁着地球上人类的安全。为了对抗Tanatos，人类正以国际太阳系开发署（ISDA）为出发点，秘密实施之前未知的开发计划“D项目”。该计划涉及使用在小笠原附近发现的神秘生命形式“龙”开发生态武器，然后使用“龙”直接摧毁Tanatos。在这个计划推进的过程中，这位两年前因事故失去家人的孤独年轻人遇到了一个神秘的女孩，她在一次命运般的邂逅中救了他。。。神秘的生命形态“龙”是一种高度智能和超攻击性的终极生命形态。在小笠原深海发现的蛋状“龙”被送往“ISDA”进行秘密修炼
