《时空快递员》的主要故事是关于“时间控制者”王小明带领“快递员”团队打开时空大门，将“纳米球”送回未来的时空，粉碎了人工智能阴谋。纳米球是将纳米机器人存储在内部的未来技术，由人工智能带入实时和空间，试图通过大规模复制加速人工智能的发展，改变历史轨迹，并最终在未来的时间和空间中消灭人类。
